四姑娘山地区的植物主要氏喜马拉雅－横断山型的植物物种，因该区域内的地质环境非常的特殊，且海拔高差大，形成了独特的植被垂直分布的特征。
在海拔3200米以上：高原型物种
2700米到3200米：高山型谷型植物
四日红杉林：以四川红杉为优势物种组成该群落体，分布在区域海拔3500高到近海拔4300米的亚高山暗针叶林带。组成群落的.有：各种杜鹃花、花楸、忍冬、中国沙棘等高山灌丛和紫果云衫、鳞皮云杉、冷杉等绿针叶物种。
中国沙棘林：分布在四姑娘山景区海拔4300米以下，与景区内大多数植被组成群落。该物种系胡颓子科，沙棘属亚种，五月花，六月果，也互生或轮生，此雄异株，是防风固沙的先锋群落，其果实含大量Vc、Va、Vp等元素。由于受景区所在地特殊生态环境的影响，四姑娘山景区沙棘可以高达23 米的乔木形式存在，且大群落分布，这在全世界来说也是罕见的，景区拥有最大胸径为193厘米的雌体大树。
方枝柏林：方枝柏林，该物种系柏科，圆柏属，寒温性极强的常绿针叶林，是柏科植物分布较高的物种之一。树枝上长着貌似动物、形态各异的苔醉类披挂着松萝地衣等植物，形成树挂景观，林下覆盖着地毯一样的地衣和苔藓等植物。林中有脚径达115厘米、高30米的巨柏。
香柏苁：柏科圆柏属的香柏，分布于林缘的乔木基部和林间空地，形成常绿灌丛。
冷杉林：松科冷杉属的冷杉，分布在三条沟的宽谷河滩及阴坡一面，在四姑娘山景区内很少见有纯林，几乎都与麦吊杉、紫果云杉等混交，冷杉常在群落中成为优势种和建群种。
红桦树：桦木科桦木属的红桦星落叶阔叶树，主要分布于长坪沟的双桥沟阴山面的中上部位，海拔3250－3450米。红桦树皮斑驳，在夕阳余晖逆射之下金红通亮，煞是好看。
川杨树：杨柳科杨属的川杨树在四姑娘山景区组成典型河岸落叶阔叶林植被类型，沿双桥沟入口后不远的一条狭长的谷底河滩地展布，绵延数公里。川杨是惟一构成群落乔木层的种类，成为纯林。林下生长着两种珍稀濒危植物挑儿七和无味五福花。
皂柳林：杨柳科柳属皂柳是四姑娘山河岸落叶阔叶林值被类型，主要分布于长坪沟枯树滩以上的沟边河滩地，海擞3500－3600米。皂柳多为丛生状均匀分布于林中，每丛10－20枝萌条，高度相当一致，均在9米左右。皂柳多生长在溪边路侧，依山傍水。
冷、云杉林：
A:冷、云衫均属松科云杉属，麦吊云杉是国家三级保护植物，广泛分布于景区海拔3400－3850米的谷沟阴坡地带，常成为群落共优种、共建种或伴生种，数量大。最大植株见于长坪沟，高达50余来，胸径116厘米台。
B：紫果云杉在景区内很少有纯林，多与鳞皮云杉、冷杉等混交。景区最大植株见于双桥沟，高达32米，胸径达138厘米。
C：鳞皮云杉在景区内多与云杉等乔木混交，行成的群落结构稳固，在该区内已进入很高的演化程度甚至接近顶级群落阶段，最大植株见于双桥沟，其离达28 米，脚径达89厘米。
D：冷杉分布在三条沟的宽谷河滩及阴坡一面，在四姑娘山景区内很少见有纯林，几乎都与麦吊杉、紫果云杉、鳞皮云杉等混交，冷杉常在群落中成为优势种和建群种。
珍稀特色植物：景区（含保护区）分布40余种古老、珍贵、稀有的特色植物，400余种野生花卉和观赏植物。其中保护植物有狭叶瓶草、独叶草、四川牡丹、桃儿七、泯江柏木、大叶柳等。
花期花季
赏花观红叶金色沙棘
1、赏花时间：4 月中旬－6 月下旬
品种：近20个品种的杜鹃花、高原三大名花之一的龙胆花14 种，川芍药，开花时为粉色，具有很高的观赏价值。
特点：此时赏花还有一绝妙之处就是赏花的同时仍然可以看到白雪。白雪覆盖在鲜花之赏，鲜花依然盛开，娇美无比。
地点：海子沟拜姑脚至锅庄坪、双桥沟阴阳谷、长坪沟。
2、赏花时间：5月－7 月下旬
品种：各种高山花卉－单叶绿绒蒿、多刺绿绒蒿、全缘绿绒蒿（高原格桑花）、蒲公英、紫菀、梅花草、火绒草等18 种五彩缤纷的典型亚高山和高山草甸，禾叶报春花、假百合、西藏杓兰、尖叶百合、四川玉兰花等高山花卉。
地点；巴朗山，长坪沟木骡子至水打坝、海子沟、双桥沟人参果坪、布达拉峰、红衫林深处。
3、赏红叶
观赏时间：9 月中旬－11 月下旬
品种：高山红叶、四川红杉
地点：巴明山、长坪沟水打坝、木骡子，双桥沟人参果坪、猎人峰、红杉林、海子沟大海子、犀牛海。
4、金色沙棘
观赏时间：8月中旬－11月下旬
地点：双桥沟人参果坪，盆景滩一线连绵13 公里，长坪沟枯树滩南岸。
书香门第
