对注册企业监督管理的方式包括：
1、日常监督管理
由检验检疫机构派员对卫生注册企业实施日常监督管理。
2、定期监督检查
直属检验检疫局组织卫生注册评审员对卫生注册企业定期实施监督检查。
(1)对肉类、水产、罐头、肠衣类卫生注册企业，每年至少组织一次全面监督检查。
(2)对季节性出口产品的卫生注册企业，应当按照生产季节进行监督检查。
(3)对获得国外卫生注册的企业，应当至少每半年(或者生产季节)进行一次全面监督检查。
(4)对其他卫生注册企业，直属检验检疫局可视具体情况确定监督检查次数。
3、换证复查
出口食品注册企业应当在证书有效期满前3个月向直属检验检疫局提出复查申请。合格的予以换证，不合格的或者未申请换证的.不予换证。
4、在对卫生注册企业的监督管理过程中，有下列情形之一的，直属检验检疫局应当书面通知企业限期整改，并暂停受理其出口报检，直至确认企业整改符合要求：
(1)发现有对产品安全卫生质量构成严重威胁的因素，不能保证其产品安全卫生质量的;
(2)经出口检验检疫发现产品安全卫生质量不合格，且情况严重的。
5、在对卫生注册企业的监督管理过程中，有下列情形之一的，吊销其卫生注册证书：
(1)有上述“监督管理”第4项所列情形，且在限期内未完成整改的;
(2)企业因原料、生产、加工、储存内部管理等原因，其产品在国外出现卫生质量问题造成不良影响的;
(3)企业隐瞒出口产品安全卫生质量问题的事实真相，造成严重后果的;
(4)企业拒不接受监督管理的;
(5)借用、冒用、转让、涂改、伪造卫生注册证书、注册编号、卫生注册标志，或者本企业未注册食品使用本企业注册食品的注册编号的。
被吊销卫生注册证书的企业，自收到吊销通知书之日起1年内不得重新提出卫生注册申请。
6、有下列情形之一的，视为企业的卫生注册资格自动失效：(重要考点)
(1)卫生注册企业的名称、法人代表或者通讯地址发生变化后30日内未申请变更的;
(2)卫生注册企业的生产车间改建、扩建、迁址完毕或者其卫生质量体系发生重大变化后30日内未申请复查的;
(3)1年内没有出口注册范围内食品的
(4)逾期未申请换证复查的。
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